Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
TNIKQ9UKE5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
TNIKQ9UKE5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
TNIKQ9UKE5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
TNIKQ9UKE5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
TNIKQ9UKE5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC37.97■■■■□ 3.67
TNIKQ9UKE5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC37.97■■■■□ 3.67
TNIKQ9UKE5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
TNIKQ9UKE5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC37.96■■■■□ 3.67
TNIKQ9UKE5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
TNIKQ9UKE5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
TNIKQ9UKE5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
TNIKQ9UKE5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
TNIKQ9UKE5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
TNIKQ9UKE5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
TNIKQ9UKE5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
TNIKQ9UKE5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
TNIKQ9UKE5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
TNIKQ9UKE5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
TNIKQ9UKE5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
TNIKQ9UKE5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
TNIKQ9UKE5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC37.93■■■■□ 3.66
TNIKQ9UKE5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
TNIKQ9UKE5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
TNIKQ9UKE5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
TNIKQ9UKE5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
TNIKQ9UKE5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
TNIKQ9UKE5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
TNIKQ9UKE5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
TNIKQ9UKE5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
TNIKQ9UKE5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
TNIKQ9UKE5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
TNIKQ9UKE5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
TNIKQ9UKE5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
TNIKQ9UKE5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
TNIKQ9UKE5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
TNIKQ9UKE5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
TNIKQ9UKE5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
TNIKQ9UKE5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
TNIKQ9UKE5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
TNIKQ9UKE5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
TNIKQ9UKE5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
TNIKQ9UKE5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
TNIKQ9UKE5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
TNIKQ9UKE5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
TNIKQ9UKE5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
TNIKQ9UKE5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
TNIKQ9UKE5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
TNIKQ9UKE5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
TNIKQ9UKE5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
TNIKQ9UKE5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
TNIKQ9UKE5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
TNIKQ9UKE5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
TNIKQ9UKE5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
TNIKQ9UKE5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
TNIKQ9UKE5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
TNIKQ9UKE5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
TNIKQ9UKE5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
TNIKQ9UKE5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
TNIKQ9UKE5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
TNIKQ9UKE5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
TNIKQ9UKE5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
TNIKQ9UKE5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
TNIKQ9UKE5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
TNIKQ9UKE5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
TNIKQ9UKE5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.83■■■■□ 3.65
TNIKQ9UKE5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
TNIKQ9UKE5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
TNIKQ9UKE5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
TNIKQ9UKE5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
TNIKQ9UKE5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
TNIKQ9UKE5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
TNIKQ9UKE5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC37.82■■■■□ 3.65
TNIKQ9UKE5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.65
TNIKQ9UKE5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC37.82■■■■□ 3.65
TNIKQ9UKE5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC37.82■■■■□ 3.65
TNIKQ9UKE5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
TNIKQ9UKE5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
TNIKQ9UKE5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
TNIKQ9UKE5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
TNIKQ9UKE5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
TNIKQ9UKE5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
TNIKQ9UKE5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
TNIKQ9UKE5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
TNIKQ9UKE5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
TNIKQ9UKE5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
TNIKQ9UKE5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
TNIKQ9UKE5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
TNIKQ9UKE5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
TNIKQ9UKE5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
TNIKQ9UKE5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
TNIKQ9UKE5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
TNIKQ9UKE5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
TNIKQ9UKE5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
TNIKQ9UKE5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
TNIKQ9UKE5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
TNIKQ9UKE5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
TNIKQ9UKE5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
TNIKQ9UKE5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
TNIKQ9UKE5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms