Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9C1

VIPAS39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPAS39Q9H9C1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
VIPAS39Q9H9C1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VIPAS39Q9H9C1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms