Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4B7

TUBB1, Tubulin beta-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB1Q9H4B7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB1Q9H4B7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TUBB1Q9H4B7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TUBB1Q9H4B7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB1Q9H4B7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB1Q9H4B7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB1Q9H4B7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB1Q9H4B7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB1Q9H4B7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB1Q9H4B7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB1Q9H4B7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB1Q9H4B7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB1Q9H4B7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB1Q9H4B7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB1Q9H4B7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB1Q9H4B7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB1Q9H4B7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB1Q9H4B7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB1Q9H4B7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB1Q9H4B7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB1Q9H4B7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB1Q9H4B7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB1Q9H4B7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB1Q9H4B7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB1Q9H4B7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB1Q9H4B7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB1Q9H4B7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB1Q9H4B7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB1Q9H4B7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB1Q9H4B7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB1Q9H4B7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB1Q9H4B7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB1Q9H4B7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB1Q9H4B7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB1Q9H4B7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB1Q9H4B7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB1Q9H4B7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB1Q9H4B7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB1Q9H4B7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB1Q9H4B7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.1 ms