Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR1EQ9GZS1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1EQ9GZS1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms