Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NIFKQ9BYG3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NIFKQ9BYG3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NIFKQ9BYG3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NIFKQ9BYG3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NIFKQ9BYG3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NIFKQ9BYG3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NIFKQ9BYG3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NIFKQ9BYG3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NIFKQ9BYG3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NIFKQ9BYG3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NIFKQ9BYG3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NIFKQ9BYG3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NIFKQ9BYG3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NIFKQ9BYG3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NIFKQ9BYG3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NIFKQ9BYG3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NIFKQ9BYG3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NIFKQ9BYG3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NIFKQ9BYG3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NIFKQ9BYG3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NIFKQ9BYG3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NIFKQ9BYG3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NIFKQ9BYG3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NIFKQ9BYG3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NIFKQ9BYG3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NIFKQ9BYG3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NIFKQ9BYG3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NIFKQ9BYG3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NIFKQ9BYG3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NIFKQ9BYG3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NIFKQ9BYG3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NIFKQ9BYG3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NIFKQ9BYG3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NIFKQ9BYG3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NIFKQ9BYG3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NIFKQ9BYG3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NIFKQ9BYG3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NIFKQ9BYG3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NIFKQ9BYG3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NIFKQ9BYG3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NIFKQ9BYG3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NIFKQ9BYG3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NIFKQ9BYG3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NIFKQ9BYG3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NIFKQ9BYG3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NIFKQ9BYG3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms