Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PACSIN1Q9BY11 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PACSIN1Q9BY11 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PACSIN1Q9BY11 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.2 ms