Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNHG12Q9BXW3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNHG12Q9BXW3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms