Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
CARD11Q9BXL7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CARD11Q9BXL7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
CARD11Q9BXL7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
CARD11Q9BXL7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CARD11Q9BXL7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
CARD11Q9BXL7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CARD11Q9BXL7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CARD11Q9BXL7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CARD11Q9BXL7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
CARD11Q9BXL7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CARD11Q9BXL7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CARD11Q9BXL7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CARD11Q9BXL7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CARD11Q9BXL7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CARD11Q9BXL7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CARD11Q9BXL7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CARD11Q9BXL7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CARD11Q9BXL7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CARD11Q9BXL7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CARD11Q9BXL7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CARD11Q9BXL7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CARD11Q9BXL7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CARD11Q9BXL7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CARD11Q9BXL7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CARD11Q9BXL7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CARD11Q9BXL7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
CARD11Q9BXL7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CARD11Q9BXL7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CARD11Q9BXL7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CARD11Q9BXL7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CARD11Q9BXL7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CARD11Q9BXL7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CARD11Q9BXL7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
CARD11Q9BXL7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CARD11Q9BXL7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CARD11Q9BXL7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CARD11Q9BXL7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CARD11Q9BXL7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CARD11Q9BXL7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CARD11Q9BXL7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CARD11Q9BXL7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CARD11Q9BXL7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CARD11Q9BXL7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CARD11Q9BXL7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CARD11Q9BXL7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CARD11Q9BXL7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CARD11Q9BXL7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CARD11Q9BXL7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CARD11Q9BXL7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CARD11Q9BXL7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CARD11Q9BXL7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CARD11Q9BXL7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
CARD11Q9BXL7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CARD11Q9BXL7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms