Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV90

SNRNP25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25Q9BV90 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRNP25Q9BV90 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRNP25Q9BV90 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRNP25Q9BV90 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRNP25Q9BV90 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRNP25Q9BV90 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRNP25Q9BV90 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRNP25Q9BV90 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRNP25Q9BV90 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRNP25Q9BV90 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNRNP25Q9BV90 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNRNP25Q9BV90 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNRNP25Q9BV90 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNRNP25Q9BV90 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNRNP25Q9BV90 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRNP25Q9BV90 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRNP25Q9BV90 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRNP25Q9BV90 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRNP25Q9BV90 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRNP25Q9BV90 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRNP25Q9BV90 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRNP25Q9BV90 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRNP25Q9BV90 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRNP25Q9BV90 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRNP25Q9BV90 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRNP25Q9BV90 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRNP25Q9BV90 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRNP25Q9BV90 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRNP25Q9BV90 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRNP25Q9BV90 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRNP25Q9BV90 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRNP25Q9BV90 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRNP25Q9BV90 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNRNP25Q9BV90 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNRNP25Q9BV90 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNRNP25Q9BV90 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNRNP25Q9BV90 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNRNP25Q9BV90 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNRNP25Q9BV90 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRNP25Q9BV90 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRNP25Q9BV90 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRNP25Q9BV90 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRNP25Q9BV90 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRNP25Q9BV90 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRNP25Q9BV90 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRNP25Q9BV90 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNRNP25Q9BV90 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms