Protein–RNA interactions for Protein: Q99496

RNF2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF2Q99496 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF2Q99496 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF2Q99496 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF2Q99496 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF2Q99496 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF2Q99496 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF2Q99496 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF2Q99496 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF2Q99496 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF2Q99496 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF2Q99496 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF2Q99496 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF2Q99496 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF2Q99496 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF2Q99496 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF2Q99496 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF2Q99496 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF2Q99496 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF2Q99496 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF2Q99496 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF2Q99496 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF2Q99496 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF2Q99496 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF2Q99496 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF2Q99496 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF2Q99496 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF2Q99496 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF2Q99496 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF2Q99496 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF2Q99496 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF2Q99496 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF2Q99496 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF2Q99496 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF2Q99496 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF2Q99496 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF2Q99496 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF2Q99496 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF2Q99496 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF2Q99496 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF2Q99496 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF2Q99496 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF2Q99496 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF2Q99496 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF2Q99496 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF2Q99496 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms