Protein–RNA interactions for Protein: Q96LM1

LINC00615, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00615, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00615Q96LM1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LINC00615Q96LM1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00615Q96LM1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms