Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM71F1Q96KD3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71F1Q96KD3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms