Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM12Q96EX1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM12Q96EX1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM12Q96EX1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms