Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NXNL1Q96CM4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NXNL1Q96CM4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NXNL1Q96CM4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NXNL1Q96CM4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NXNL1Q96CM4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NXNL1Q96CM4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NXNL1Q96CM4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NXNL1Q96CM4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NXNL1Q96CM4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NXNL1Q96CM4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms