Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TSR2Q969E8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
TSR2Q969E8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TSR2Q969E8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TSR2Q969E8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TSR2Q969E8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TSR2Q969E8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TSR2Q969E8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TSR2Q969E8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TSR2Q969E8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TSR2Q969E8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TSR2Q969E8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TSR2Q969E8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TSR2Q969E8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TSR2Q969E8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TSR2Q969E8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TSR2Q969E8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TSR2Q969E8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TSR2Q969E8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TSR2Q969E8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TSR2Q969E8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
TSR2Q969E8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TSR2Q969E8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TSR2Q969E8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TSR2Q969E8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TSR2Q969E8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TSR2Q969E8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TSR2Q969E8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TSR2Q969E8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TSR2Q969E8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TSR2Q969E8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
TSR2Q969E8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
TSR2Q969E8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC30■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
TSR2Q969E8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TSR2Q969E8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms