Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms