Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC39.53■■■■□ 3.92
TOPBP1Q92547 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
TOPBP1Q92547 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC39.53■■■■□ 3.92
TOPBP1Q92547 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
TOPBP1Q92547 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
TOPBP1Q92547 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
TOPBP1Q92547 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
TOPBP1Q92547 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
TOPBP1Q92547 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
TOPBP1Q92547 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC39.51■■■■□ 3.92
TOPBP1Q92547 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
TOPBP1Q92547 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC39.51■■■■□ 3.92
TOPBP1Q92547 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
TOPBP1Q92547 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
TOPBP1Q92547 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
TOPBP1Q92547 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
TOPBP1Q92547 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
TOPBP1Q92547 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
TOPBP1Q92547 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
TOPBP1Q92547 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
TOPBP1Q92547 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
TOPBP1Q92547 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
TOPBP1Q92547 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
TOPBP1Q92547 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
TOPBP1Q92547 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
TOPBP1Q92547 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
TOPBP1Q92547 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
TOPBP1Q92547 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
TOPBP1Q92547 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC39.47■■■■□ 3.91
TOPBP1Q92547 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
TOPBP1Q92547 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
TOPBP1Q92547 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
TOPBP1Q92547 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
TOPBP1Q92547 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
TOPBP1Q92547 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
TOPBP1Q92547 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
TOPBP1Q92547 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
TOPBP1Q92547 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC39.45■■■■□ 3.91
TOPBP1Q92547 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.42■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC39.42■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC39.42■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC39.4■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC39.4■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC39.39■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC39.39■■■■□ 3.9
TOPBP1Q92547 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
TOPBP1Q92547 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
TOPBP1Q92547 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
TOPBP1Q92547 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC39.38■■■■□ 3.89
TOPBP1Q92547 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
TOPBP1Q92547 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
TOPBP1Q92547 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
TOPBP1Q92547 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC39.38■■■■□ 3.89
TOPBP1Q92547 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
TOPBP1Q92547 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.37■■■■□ 3.89
TOPBP1Q92547 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
TOPBP1Q92547 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC39.37■■■■□ 3.89
TOPBP1Q92547 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
TOPBP1Q92547 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
TOPBP1Q92547 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
TOPBP1Q92547 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms