Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTT0

CLEC4C, C-type lectin domain family 4 member C, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4CQ8WTT0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLEC4CQ8WTT0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLEC4CQ8WTT0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLEC4CQ8WTT0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLEC4CQ8WTT0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLEC4CQ8WTT0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLEC4CQ8WTT0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLEC4CQ8WTT0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLEC4CQ8WTT0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CLEC4CQ8WTT0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLEC4CQ8WTT0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLEC4CQ8WTT0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLEC4CQ8WTT0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CLEC4CQ8WTT0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLEC4CQ8WTT0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLEC4CQ8WTT0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLEC4CQ8WTT0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLEC4CQ8WTT0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLEC4CQ8WTT0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLEC4CQ8WTT0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLEC4CQ8WTT0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLEC4CQ8WTT0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLEC4CQ8WTT0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC4CQ8WTT0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC4CQ8WTT0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC4CQ8WTT0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC4CQ8WTT0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC4CQ8WTT0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC4CQ8WTT0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC4CQ8WTT0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC4CQ8WTT0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLEC4CQ8WTT0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLEC4CQ8WTT0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLEC4CQ8WTT0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLEC4CQ8WTT0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLEC4CQ8WTT0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLEC4CQ8WTT0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLEC4CQ8WTT0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLEC4CQ8WTT0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLEC4CQ8WTT0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLEC4CQ8WTT0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLEC4CQ8WTT0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms