Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCS8

PNPT1, Polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPT1Q8TCS8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNPT1Q8TCS8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PNPT1Q8TCS8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNPT1Q8TCS8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNPT1Q8TCS8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNPT1Q8TCS8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNPT1Q8TCS8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNPT1Q8TCS8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PNPT1Q8TCS8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PNPT1Q8TCS8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PNPT1Q8TCS8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PNPT1Q8TCS8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PNPT1Q8TCS8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PNPT1Q8TCS8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PNPT1Q8TCS8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PNPT1Q8TCS8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PNPT1Q8TCS8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PNPT1Q8TCS8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PNPT1Q8TCS8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PNPT1Q8TCS8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PNPT1Q8TCS8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PNPT1Q8TCS8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PNPT1Q8TCS8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PNPT1Q8TCS8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PNPT1Q8TCS8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PNPT1Q8TCS8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PNPT1Q8TCS8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PNPT1Q8TCS8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PNPT1Q8TCS8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PNPT1Q8TCS8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PNPT1Q8TCS8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PNPT1Q8TCS8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PNPT1Q8TCS8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PNPT1Q8TCS8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PNPT1Q8TCS8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PNPT1Q8TCS8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PNPT1Q8TCS8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PNPT1Q8TCS8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms