Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC191Q8NCU4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC191Q8NCU4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC191Q8NCU4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC191Q8NCU4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC191Q8NCU4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC191Q8NCU4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC191Q8NCU4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC191Q8NCU4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC191Q8NCU4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC191Q8NCU4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC191Q8NCU4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC191Q8NCU4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC191Q8NCU4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC191Q8NCU4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC191Q8NCU4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC191Q8NCU4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC191Q8NCU4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC191Q8NCU4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC191Q8NCU4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC191Q8NCU4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC191Q8NCU4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC191Q8NCU4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC191Q8NCU4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC191Q8NCU4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC191Q8NCU4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC191Q8NCU4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC191Q8NCU4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC191Q8NCU4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC191Q8NCU4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC191Q8NCU4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC191Q8NCU4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC191Q8NCU4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC191Q8NCU4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC191Q8NCU4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC191Q8NCU4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC191Q8NCU4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC191Q8NCU4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC191Q8NCU4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC191Q8NCU4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC191Q8NCU4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC191Q8NCU4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC191Q8NCU4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC191Q8NCU4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC191Q8NCU4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC191Q8NCU4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC191Q8NCU4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC191Q8NCU4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC191Q8NCU4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC191Q8NCU4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC191Q8NCU4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC191Q8NCU4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC191Q8NCU4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC191Q8NCU4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC191Q8NCU4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC191Q8NCU4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC191Q8NCU4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC191Q8NCU4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC191Q8NCU4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC191Q8NCU4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC191Q8NCU4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC191Q8NCU4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC191Q8NCU4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC191Q8NCU4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC191Q8NCU4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC191Q8NCU4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC191Q8NCU4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC191Q8NCU4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC191Q8NCU4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC191Q8NCU4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC191Q8NCU4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC191Q8NCU4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC191Q8NCU4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC191Q8NCU4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC191Q8NCU4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC191Q8NCU4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC191Q8NCU4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CCDC191Q8NCU4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CCDC191Q8NCU4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC191Q8NCU4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC191Q8NCU4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC191Q8NCU4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC191Q8NCU4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC191Q8NCU4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC191Q8NCU4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC191Q8NCU4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC191Q8NCU4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC191Q8NCU4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC191Q8NCU4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC191Q8NCU4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC191Q8NCU4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC191Q8NCU4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC191Q8NCU4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC191Q8NCU4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC191Q8NCU4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC191Q8NCU4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC191Q8NCU4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC191Q8NCU4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC191Q8NCU4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC191Q8NCU4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 236.3 ms