Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I0

SYT2, Synaptotagmin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT2Q8N9I0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYT2Q8N9I0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYT2Q8N9I0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYT2Q8N9I0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYT2Q8N9I0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYT2Q8N9I0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYT2Q8N9I0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYT2Q8N9I0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYT2Q8N9I0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYT2Q8N9I0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SYT2Q8N9I0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYT2Q8N9I0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYT2Q8N9I0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYT2Q8N9I0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYT2Q8N9I0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SYT2Q8N9I0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYT2Q8N9I0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYT2Q8N9I0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYT2Q8N9I0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYT2Q8N9I0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYT2Q8N9I0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYT2Q8N9I0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYT2Q8N9I0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYT2Q8N9I0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYT2Q8N9I0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYT2Q8N9I0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYT2Q8N9I0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYT2Q8N9I0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYT2Q8N9I0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYT2Q8N9I0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYT2Q8N9I0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYT2Q8N9I0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYT2Q8N9I0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYT2Q8N9I0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SYT2Q8N9I0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYT2Q8N9I0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SYT2Q8N9I0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYT2Q8N9I0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYT2Q8N9I0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYT2Q8N9I0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYT2Q8N9I0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYT2Q8N9I0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SYT2Q8N9I0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SYT2Q8N9I0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYT2Q8N9I0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYT2Q8N9I0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYT2Q8N9I0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms