Protein–RNA interactions for Protein: Q8N695

SLC5A8, Sodium-coupled monocarboxylate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A8Q8N695 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC5A8Q8N695 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC5A8Q8N695 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC5A8Q8N695 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC5A8Q8N695 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC5A8Q8N695 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC5A8Q8N695 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC5A8Q8N695 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC5A8Q8N695 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC5A8Q8N695 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC5A8Q8N695 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC5A8Q8N695 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC5A8Q8N695 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC5A8Q8N695 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC5A8Q8N695 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC5A8Q8N695 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC5A8Q8N695 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC5A8Q8N695 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC5A8Q8N695 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC5A8Q8N695 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC5A8Q8N695 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC5A8Q8N695 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC5A8Q8N695 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC5A8Q8N695 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC5A8Q8N695 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC5A8Q8N695 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC5A8Q8N695 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC5A8Q8N695 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC5A8Q8N695 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC5A8Q8N695 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC5A8Q8N695 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC5A8Q8N695 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC5A8Q8N695 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms