Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC82Q8N4S0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC82Q8N4S0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC82Q8N4S0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC82Q8N4S0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC82Q8N4S0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC82Q8N4S0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC82Q8N4S0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC82Q8N4S0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC82Q8N4S0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC82Q8N4S0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC82Q8N4S0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC82Q8N4S0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC82Q8N4S0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC82Q8N4S0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC82Q8N4S0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC82Q8N4S0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC82Q8N4S0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC82Q8N4S0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC82Q8N4S0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC82Q8N4S0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC82Q8N4S0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC82Q8N4S0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC82Q8N4S0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC82Q8N4S0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC82Q8N4S0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC82Q8N4S0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms