Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC11Q7Z392 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC11Q7Z392 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC11Q7Z392 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC11Q7Z392 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC11Q7Z392 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC11Q7Z392 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms