Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF06

TRMT10B, tRNA methyltransferase 10 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT10BQ6PF06 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMT10BQ6PF06 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRMT10BQ6PF06 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 998.9 ms