Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
WSCD1Q658N2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
WSCD1Q658N2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WSCD1Q658N2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms