Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVC0

C1orf146, Uncharacterized protein C1orf146, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf146Q5VVC0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf146Q5VVC0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf146Q5VVC0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf146Q5VVC0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf146Q5VVC0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf146Q5VVC0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf146Q5VVC0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf146Q5VVC0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf146Q5VVC0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf146Q5VVC0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf146Q5VVC0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf146Q5VVC0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1orf146Q5VVC0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1orf146Q5VVC0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf146Q5VVC0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf146Q5VVC0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 262.9 ms