Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC181Q5TID7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC181Q5TID7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms