Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
UBAP2Q5T6F2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UBAP2Q5T6F2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms