Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PHYHD1Q5SRE7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHYHD1Q5SRE7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms