Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFT2D3Q587I9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFT2D3Q587I9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFT2D3Q587I9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms