Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP6V1FQ16864 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP6V1FQ16864 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP6V1FQ16864 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP6V1FQ16864 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP6V1FQ16864 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP6V1FQ16864 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
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