Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ME3Q16798 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ME3Q16798 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ME3Q16798 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ME3Q16798 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ME3Q16798 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ME3Q16798 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ME3Q16798 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ME3Q16798 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ME3Q16798 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ME3Q16798 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ME3Q16798 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ME3Q16798 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ME3Q16798 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ME3Q16798 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ME3Q16798 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ME3Q16798 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ME3Q16798 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ME3Q16798 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ME3Q16798 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ME3Q16798 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ME3Q16798 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ME3Q16798 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ME3Q16798 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ME3Q16798 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ME3Q16798 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ME3Q16798 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ME3Q16798 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ME3Q16798 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ME3Q16798 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ME3Q16798 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ME3Q16798 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ME3Q16798 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ME3Q16798 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ME3Q16798 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ME3Q16798 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ME3Q16798 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ME3Q16798 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ME3Q16798 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ME3Q16798 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ME3Q16798 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ME3Q16798 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ME3Q16798 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ME3Q16798 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ME3Q16798 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ME3Q16798 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ME3Q16798 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ME3Q16798 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ME3Q16798 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ME3Q16798 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ME3Q16798 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ME3Q16798 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ME3Q16798 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ME3Q16798 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ME3Q16798 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ME3Q16798 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ME3Q16798 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ME3Q16798 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ME3Q16798 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ME3Q16798 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ME3Q16798 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ME3Q16798 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ME3Q16798 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ME3Q16798 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ME3Q16798 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ME3Q16798 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ME3Q16798 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ME3Q16798 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ME3Q16798 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ME3Q16798 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ME3Q16798 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ME3Q16798 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ME3Q16798 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ME3Q16798 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ME3Q16798 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ME3Q16798 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ME3Q16798 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ME3Q16798 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
ME3Q16798 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ME3Q16798 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ME3Q16798 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ME3Q16798 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ME3Q16798 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ME3Q16798 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ME3Q16798 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ME3Q16798 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ME3Q16798 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ME3Q16798 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ME3Q16798 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ME3Q16798 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ME3Q16798 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ME3Q16798 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ME3Q16798 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ME3Q16798 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ME3Q16798 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ME3Q16798 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ME3Q16798 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ME3Q16798 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ME3Q16798 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ME3Q16798 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
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