Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTF1Q16619 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTF1Q16619 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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