Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
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NEDD8Q15843 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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NEDD8Q15843 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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NEDD8Q15843 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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NEDD8Q15843 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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NEDD8Q15843 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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NEDD8Q15843 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEDD8Q15843 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NEDD8Q15843 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
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