Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TRDNQ13061 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRDNQ13061 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRDNQ13061 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRDNQ13061 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRDNQ13061 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRDNQ13061 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRDNQ13061 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRDNQ13061 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRDNQ13061 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRDNQ13061 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRDNQ13061 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRDNQ13061 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRDNQ13061 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRDNQ13061 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TRDNQ13061 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRDNQ13061 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRDNQ13061 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TRDNQ13061 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRDNQ13061 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRDNQ13061 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRDNQ13061 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRDNQ13061 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRDNQ13061 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRDNQ13061 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRDNQ13061 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRDNQ13061 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRDNQ13061 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRDNQ13061 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRDNQ13061 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRDNQ13061 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRDNQ13061 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRDNQ13061 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRDNQ13061 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TRDNQ13061 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRDNQ13061 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRDNQ13061 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TRDNQ13061 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRDNQ13061 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
TRDNQ13061 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRDNQ13061 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRDNQ13061 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRDNQ13061 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRDNQ13061 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRDNQ13061 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRDNQ13061 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRDNQ13061 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRDNQ13061 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRDNQ13061 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRDNQ13061 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
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