Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 PFA3YNL326C 1011 nt6.14□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 NRM1YNR009W 750 nt6.14□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 YCL041CYCL041C 495 nt6.14□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 HER2YMR293C 1395 nt6.14□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 YPL245WYPL245W 1365 nt6.14□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 YHR095WYHR095W 495 nt6.13□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 PHO86YJL117W 936 nt6.13□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 YLR283WYLR283W 945 nt6.13□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 MTF1YMR228W 1026 nt6.13□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 snR32snR32 188 nt6.13□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 NGL2YMR285C 1548 nt6.13□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 PMT2YAL023C 2280 nt6.13□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 GET3YDL100C 1065 nt6.12□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 MTQ2YDR140W 666 nt6.12□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 PHO8YDR481C 1701 nt6.12□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 GAT4YIR013C 366 nt6.12□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 UTP18YJL069C 1785 nt6.12□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 SED5YLR026C 1023 nt6.12□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 GYP1YOR070C 1914 nt6.12□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 SAM4YPL273W 978 nt6.12□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 BAP2YBR068C 1830 nt6.12□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 FHL1YPR104C 2811 nt6.12□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 YNL095CYNL095C 1929 nt6.11□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 DBP9YLR276C 1785 nt6.11□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 NOB1YOR056C 1380 nt6.11□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 RMD5YDR255C 1266 nt6.11□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 SEC13YLR208W 894 nt6.11□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 ACC1YNR016C 6702 nt6.11□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 MMP1YLL061W 1752 nt6.11□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 SPC97YHR172W 2472 nt6.1□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 ALD6YPL061W 1503 nt6.1□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 TOS4YLR183C 1470 nt6.1□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 YIR043CYIR043C 693 nt6.1□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 CLP1YOR250C 1338 nt6.09□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 RAM1YDL090C 1296 nt6.09□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 MAF1YDR005C 1188 nt6.09□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 PRM10YJL108C 1152 nt6.09□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 CBF1YJR060W 1056 nt6.09□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 POM33YLL023C 840 nt6.09□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 VTA1YLR181C 993 nt6.09□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 SSO1YPL232W 873 nt6.09□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 DED81YHR019C 1665 nt6.09□□□□□ -1.43
CLF1Q12309 MMR1YLR190W 1476 nt6.09□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 PAF1YBR279W 1338 nt6.08□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 DPH2YKL191W 1605 nt6.08□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 IPK1YDR315C 846 nt6.08□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 YDR541CYDR541C 1035 nt6.08□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 SIP2YGL208W 1248 nt6.08□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 PDE1YGL248W 1110 nt6.08□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 IPI1YHR085W 1005 nt6.08□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 SFC1YJR095W 969 nt6.08□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 PEX22YAL055W 543 nt6.08□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 UBC12YLR306W 567 nt6.08□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 TIP41YPR040W 1071 nt6.08□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 DFG5YMR238W 1377 nt6.07□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 ENT2YLR206W 1842 nt6.07□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 YDR509WYDR509W 348 nt6.07□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 SPC42YKL042W 1092 nt6.07□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 YKL107WYKL107W 930 nt6.07□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 SPO77YLR341W 1434 nt6.07□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 VPS70YJR126C 2436 nt6.06□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 YAP1YML007W 1953 nt6.06□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 NDC1YML031W 1968 nt6.06□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 IMG2YCR071C 441 nt6.06□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 MED2YDL005C 1296 nt6.06□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 OMA1YKR087C 1038 nt6.06□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 PML1YLR016C 615 nt6.06□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 ARH1YDR376W 1482 nt6.06□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 SFB3YHR098C 2790 nt6.06□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 RTN1YDR233C 888 nt6.05□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 URA3YEL021W 804 nt6.05□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 PCL6YER059W 1263 nt6.05□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 YHR127WYHR127W 732 nt6.05□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 YJR056CYJR056C 711 nt6.05□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 PSH1YOL054W 1221 nt6.05□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 ERI1YPL096C-A 207 nt6.05□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 LPL1YOR059C 1353 nt6.05□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 ULA1YPL003W 1389 nt6.05□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 CLB5YPR120C 1308 nt6.04□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 HST4YDR191W 1113 nt6.04□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 ARC19YKL013C 516 nt6.04□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 ADD37YMR184W 597 nt6.04□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 YOL024WYOL024W 519 nt6.04□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 RER2YBR002C 861 nt6.04□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 AME1YBR211C 975 nt6.04□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 VMA13YPR036W 1437 nt6.04□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 MKK2YPL140C 1521 nt6.04□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 WTM1YOR230W 1314 nt6.03□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 UBA1YKL210W 3075 nt6.03□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 MTC1YJL123C 1437 nt6.03□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 TDH3YGR192C 999 nt6.03□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 XPT1YJR133W 630 nt6.03□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 GPM3YOL056W 912 nt6.03□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 YPL168WYPL168W 1293 nt6.03□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 AFT1YGL071W 2073 nt6.03□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 UBX2YML013W 1755 nt6.03□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 YDR132CYDR132C 1488 nt6.02□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 ARN2YHL047C 1863 nt6.02□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 FRE7YOL152W 1863 nt6.02□□□□□ -1.44
CLF1Q12309 ASP1YDR321W 1146 nt6.02□□□□□ -1.45
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