Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC18A2Q05940 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC18A2Q05940 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms