Protein–RNA interactions for Protein: Q02156

PRKCE, Protein kinase C epsilon type, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCEQ02156 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRKCEQ02156 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKCEQ02156 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKCEQ02156 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKCEQ02156 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKCEQ02156 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKCEQ02156 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKCEQ02156 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKCEQ02156 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKCEQ02156 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKCEQ02156 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKCEQ02156 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKCEQ02156 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms