Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FAM193AP78312 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms