Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNB1P62873 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNB1P62873 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNB1P62873 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNB1P62873 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNB1P62873 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNB1P62873 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNB1P62873 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNB1P62873 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNB1P62873 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNB1P62873 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNB1P62873 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNB1P62873 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNB1P62873 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNB1P62873 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNB1P62873 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNB1P62873 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNB1P62873 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GNB1P62873 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GNB1P62873 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GNB1P62873 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GNB1P62873 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GNB1P62873 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GNB1P62873 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GNB1P62873 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNB1P62873 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNB1P62873 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNB1P62873 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNB1P62873 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNB1P62873 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNB1P62873 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNB1P62873 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNB1P62873 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNB1P62873 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNB1P62873 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
GNB1P62873 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNB1P62873 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNB1P62873 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNB1P62873 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNB1P62873 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNB1P62873 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNB1P62873 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNB1P62873 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GNB1P62873 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GNB1P62873 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNB1P62873 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNB1P62873 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNB1P62873 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GNB1P62873 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GNB1P62873 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GNB1P62873 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GNB1P62873 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GNB1P62873 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GNB1P62873 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GNB1P62873 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GNB1P62873 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GNB1P62873 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GNB1P62873 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GNB1P62873 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GNB1P62873 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GNB1P62873 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNB1P62873 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNB1P62873 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNB1P62873 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNB1P62873 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNB1P62873 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNB1P62873 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNB1P62873 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNB1P62873 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNB1P62873 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNB1P62873 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNB1P62873 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNB1P62873 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNB1P62873 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNB1P62873 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNB1P62873 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNB1P62873 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNB1P62873 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNB1P62873 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GNB1P62873 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GNB1P62873 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GNB1P62873 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GNB1P62873 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GNB1P62873 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GNB1P62873 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GNB1P62873 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GNB1P62873 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GNB1P62873 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GNB1P62873 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GNB1P62873 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GNB1P62873 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GNB1P62873 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GNB1P62873 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GNB1P62873 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GNB1P62873 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GNB1P62873 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GNB1P62873 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GNB1P62873 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GNB1P62873 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GNB1P62873 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms