Protein–RNA interactions for Protein: P61586

RHOA, Transforming protein RhoA, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOAP61586 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOAP61586 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOAP61586 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOAP61586 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOAP61586 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOAP61586 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOAP61586 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOAP61586 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOAP61586 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOAP61586 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RHOAP61586 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOAP61586 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOAP61586 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOAP61586 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOAP61586 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOAP61586 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOAP61586 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOAP61586 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOAP61586 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOAP61586 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOAP61586 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOAP61586 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOAP61586 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOAP61586 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOAP61586 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOAP61586 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOAP61586 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOAP61586 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOAP61586 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOAP61586 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOAP61586 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOAP61586 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOAP61586 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOAP61586 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOAP61586 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOAP61586 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOAP61586 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOAP61586 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOAP61586 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOAP61586 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOAP61586 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOAP61586 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOAP61586 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOAP61586 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOAP61586 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOAP61586 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOAP61586 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOAP61586 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOAP61586 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOAP61586 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOAP61586 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOAP61586 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOAP61586 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOAP61586 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOAP61586 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOAP61586 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOAP61586 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOAP61586 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOAP61586 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOAP61586 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOAP61586 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOAP61586 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOAP61586 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOAP61586 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOAP61586 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOAP61586 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOAP61586 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOAP61586 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOAP61586 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOAP61586 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOAP61586 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOAP61586 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOAP61586 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOAP61586 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOAP61586 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOAP61586 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOAP61586 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOAP61586 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOAP61586 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOAP61586 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RHOAP61586 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RHOAP61586 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RHOAP61586 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RHOAP61586 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RHOAP61586 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RHOAP61586 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOAP61586 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOAP61586 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOAP61586 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOAP61586 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOAP61586 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOAP61586 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOAP61586 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOAP61586 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOAP61586 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOAP61586 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOAP61586 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOAP61586 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOAP61586 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOAP61586 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms