Protein–RNA interactions for Protein: P58294

PROK1, Prokineticin-1, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROK1P58294 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PROK1P58294 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PROK1P58294 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PROK1P58294 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PROK1P58294 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PROK1P58294 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PROK1P58294 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PROK1P58294 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PROK1P58294 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PROK1P58294 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PROK1P58294 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PROK1P58294 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PROK1P58294 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PROK1P58294 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PROK1P58294 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PROK1P58294 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PROK1P58294 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PROK1P58294 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PROK1P58294 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PROK1P58294 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PROK1P58294 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PROK1P58294 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PROK1P58294 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PROK1P58294 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PROK1P58294 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PROK1P58294 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PROK1P58294 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PROK1P58294 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PROK1P58294 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PROK1P58294 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PROK1P58294 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PROK1P58294 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PROK1P58294 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PROK1P58294 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PROK1P58294 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PROK1P58294 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PROK1P58294 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PROK1P58294 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PROK1P58294 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PROK1P58294 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PROK1P58294 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PROK1P58294 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PROK1P58294 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PROK1P58294 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PROK1P58294 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PROK1P58294 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PROK1P58294 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PROK1P58294 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PROK1P58294 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PROK1P58294 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PROK1P58294 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PROK1P58294 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PROK1P58294 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PROK1P58294 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PROK1P58294 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PROK1P58294 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PROK1P58294 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PROK1P58294 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PROK1P58294 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PROK1P58294 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PROK1P58294 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PROK1P58294 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PROK1P58294 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PROK1P58294 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PROK1P58294 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PROK1P58294 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PROK1P58294 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PROK1P58294 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PROK1P58294 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PROK1P58294 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PROK1P58294 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PROK1P58294 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PROK1P58294 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PROK1P58294 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PROK1P58294 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PROK1P58294 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PROK1P58294 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PROK1P58294 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PROK1P58294 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PROK1P58294 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PROK1P58294 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PROK1P58294 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PROK1P58294 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PROK1P58294 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PROK1P58294 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PROK1P58294 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PROK1P58294 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PROK1P58294 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PROK1P58294 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PROK1P58294 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PROK1P58294 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PROK1P58294 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PROK1P58294 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PROK1P58294 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PROK1P58294 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PROK1P58294 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PROK1P58294 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PROK1P58294 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PROK1P58294 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PROK1P58294 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms