Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PMS1P54277 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PMS1P54277 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PMS1P54277 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PMS1P54277 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PMS1P54277 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PMS1P54277 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PMS1P54277 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PMS1P54277 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PMS1P54277 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PMS1P54277 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PMS1P54277 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PMS1P54277 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PMS1P54277 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PMS1P54277 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PMS1P54277 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PMS1P54277 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PMS1P54277 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PMS1P54277 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PMS1P54277 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PMS1P54277 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PMS1P54277 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PMS1P54277 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PMS1P54277 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PMS1P54277 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PMS1P54277 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PMS1P54277 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PMS1P54277 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PMS1P54277 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PMS1P54277 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PMS1P54277 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PMS1P54277 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PMS1P54277 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PMS1P54277 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PMS1P54277 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PMS1P54277 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PMS1P54277 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PMS1P54277 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PMS1P54277 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PMS1P54277 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PMS1P54277 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PMS1P54277 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PMS1P54277 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PMS1P54277 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PMS1P54277 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PMS1P54277 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PMS1P54277 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PMS1P54277 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PMS1P54277 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PMS1P54277 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PMS1P54277 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PMS1P54277 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PMS1P54277 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PMS1P54277 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PMS1P54277 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PMS1P54277 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PMS1P54277 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PMS1P54277 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PMS1P54277 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PMS1P54277 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PMS1P54277 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PMS1P54277 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PMS1P54277 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PMS1P54277 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PMS1P54277 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PMS1P54277 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PMS1P54277 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PMS1P54277 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PMS1P54277 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PMS1P54277 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PMS1P54277 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PMS1P54277 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PMS1P54277 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PMS1P54277 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PMS1P54277 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PMS1P54277 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PMS1P54277 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PMS1P54277 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PMS1P54277 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PMS1P54277 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PMS1P54277 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PMS1P54277 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PMS1P54277 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PMS1P54277 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PMS1P54277 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PMS1P54277 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PMS1P54277 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PMS1P54277 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PMS1P54277 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PMS1P54277 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PMS1P54277 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PMS1P54277 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PMS1P54277 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PMS1P54277 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PMS1P54277 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PMS1P54277 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PMS1P54277 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PMS1P54277 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PMS1P54277 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PMS1P54277 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms