Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
UTRNP46939 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
UTRNP46939 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
UTRNP46939 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
UTRNP46939 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
UTRNP46939 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
UTRNP46939 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UTRNP46939 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
UTRNP46939 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
UTRNP46939 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UTRNP46939 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UTRNP46939 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UTRNP46939 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
UTRNP46939 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
UTRNP46939 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
UTRNP46939 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
UTRNP46939 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
UTRNP46939 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
UTRNP46939 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
UTRNP46939 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
UTRNP46939 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
UTRNP46939 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
UTRNP46939 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
UTRNP46939 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
UTRNP46939 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
UTRNP46939 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
UTRNP46939 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UTRNP46939 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UTRNP46939 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
UTRNP46939 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UTRNP46939 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
UTRNP46939 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
UTRNP46939 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
UTRNP46939 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
UTRNP46939 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
UTRNP46939 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
UTRNP46939 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
UTRNP46939 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
UTRNP46939 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UTRNP46939 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UTRNP46939 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
UTRNP46939 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
UTRNP46939 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
UTRNP46939 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UTRNP46939 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UTRNP46939 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UTRNP46939 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
UTRNP46939 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
UTRNP46939 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
UTRNP46939 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UTRNP46939 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
UTRNP46939 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UTRNP46939 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UTRNP46939 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
UTRNP46939 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
UTRNP46939 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
UTRNP46939 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UTRNP46939 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UTRNP46939 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UTRNP46939 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UTRNP46939 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UTRNP46939 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UTRNP46939 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UTRNP46939 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
UTRNP46939 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UTRNP46939 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UTRNP46939 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UTRNP46939 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UTRNP46939 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UTRNP46939 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
UTRNP46939 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
UTRNP46939 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UTRNP46939 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
UTRNP46939 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
UTRNP46939 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UTRNP46939 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UTRNP46939 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UTRNP46939 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UTRNP46939 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UTRNP46939 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UTRNP46939 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UTRNP46939 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UTRNP46939 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
UTRNP46939 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
UTRNP46939 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
UTRNP46939 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
UTRNP46939 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
UTRNP46939 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UTRNP46939 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UTRNP46939 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UTRNP46939 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UTRNP46939 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
UTRNP46939 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
UTRNP46939 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UTRNP46939 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
UTRNP46939 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UTRNP46939 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UTRNP46939 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
UTRNP46939 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UTRNP46939 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms