Protein–RNA interactions for Protein: P42772

CDKN2B, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2BP42772 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDKN2BP42772 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDKN2BP42772 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDKN2BP42772 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDKN2BP42772 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDKN2BP42772 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDKN2BP42772 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKN2BP42772 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKN2BP42772 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKN2BP42772 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKN2BP42772 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKN2BP42772 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKN2BP42772 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKN2BP42772 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKN2BP42772 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKN2BP42772 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKN2BP42772 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKN2BP42772 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDKN2BP42772 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKN2BP42772 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKN2BP42772 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKN2BP42772 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKN2BP42772 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKN2BP42772 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDKN2BP42772 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKN2BP42772 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDKN2BP42772 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms