Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 RCK1YGL158W 1539 nt4.8□□□□□ -1.64
DDI1P40087 TUL1YKL034W 2277 nt4.8□□□□□ -1.64
DDI1P40087 PUF3YLL013C 2640 nt4.79□□□□□ -1.64
DDI1P40087 RAD16YBR114W 2373 nt4.79□□□□□ -1.64
DDI1P40087 SFI1YLL003W 2841 nt4.79□□□□□ -1.64
DDI1P40087 AUA1YFL010W-A 285 nt4.79□□□□□ -1.64
DDI1P40087 SUA5YGL169W 1281 nt4.79□□□□□ -1.64
DDI1P40087 UIP4YPL186C 915 nt4.79□□□□□ -1.64
DDI1P40087 RSC6YCR052W 1452 nt4.79□□□□□ -1.64
DDI1P40087 YMD8YML038C 1329 nt4.78□□□□□ -1.64
DDI1P40087 YDL034WYDL034W 345 nt4.78□□□□□ -1.64
DDI1P40087 URA3YEL021W 804 nt4.78□□□□□ -1.64
DDI1P40087 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt4.78□□□□□ -1.64
DDI1P40087 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt4.78□□□□□ -1.64
DDI1P40087 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt4.78□□□□□ -1.64
DDI1P40087 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt4.78□□□□□ -1.64
DDI1P40087 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt4.78□□□□□ -1.64
DDI1P40087 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt4.78□□□□□ -1.64
DDI1P40087 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt4.78□□□□□ -1.64
DDI1P40087 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt4.78□□□□□ -1.64
DDI1P40087 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt4.78□□□□□ -1.64
DDI1P40087 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt4.78□□□□□ -1.64
DDI1P40087 HSX1tR(CCU)J 72 nt4.78□□□□□ -1.64
DDI1P40087 SNO4YMR322C 714 nt4.78□□□□□ -1.64
DDI1P40087 MRP21YBL090W 534 nt4.78□□□□□ -1.64
DDI1P40087 HSP33YOR391C 714 nt4.78□□□□□ -1.64
DDI1P40087 TGS1YPL157W 948 nt4.78□□□□□ -1.64
DDI1P40087 HSP32YPL280W 714 nt4.78□□□□□ -1.64
DDI1P40087 QCR2YPR191W 1107 nt4.78□□□□□ -1.64
DDI1P40087 CDC28YBR160W 897 nt4.78□□□□□ -1.64
DDI1P40087 MOT2YER068W 1764 nt4.78□□□□□ -1.64
DDI1P40087 ZUO1YGR285C 1302 nt4.77□□□□□ -1.65
DDI1P40087 MSH1YHR120W 2880 nt4.77□□□□□ -1.65
DDI1P40087 GAS3YMR215W 1575 nt4.77□□□□□ -1.65
DDI1P40087 CDC19YAL038W 1503 nt4.77□□□□□ -1.65
DDI1P40087 BRE2YLR015W 1518 nt4.77□□□□□ -1.65
DDI1P40087 UBX7YBR273C 1311 nt4.76□□□□□ -1.65
DDI1P40087 MPP10YJR002W 1782 nt4.76□□□□□ -1.65
DDI1P40087 AFT1YGL071W 2073 nt4.76□□□□□ -1.65
DDI1P40087 SNF3YDL194W 2655 nt4.76□□□□□ -1.65
DDI1P40087 PRS2YER099C 957 nt4.76□□□□□ -1.65
DDI1P40087 YPT32YGL210W 669 nt4.76□□□□□ -1.65
DDI1P40087 SPL2YHR136C 447 nt4.76□□□□□ -1.65
DDI1P40087 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt4.76□□□□□ -1.65
DDI1P40087 HOF1YMR032W 2010 nt4.76□□□□□ -1.65
DDI1P40087 GRE1YPL223C 507 nt4.76□□□□□ -1.65
DDI1P40087 ROT2YBR229C 2865 nt4.76□□□□□ -1.65
DDI1P40087 APE1YKL103C 1545 nt4.76□□□□□ -1.65
DDI1P40087 MSC7YHR039C 1935 nt4.76□□□□□ -1.65
DDI1P40087 PXA1YPL147W 2613 nt4.75□□□□□ -1.65
DDI1P40087 YDL144CYDL144C 1071 nt4.75□□□□□ -1.65
DDI1P40087 ASP1YDR321W 1146 nt4.75□□□□□ -1.65
DDI1P40087 RPL34AYER056C-A 366 nt4.75□□□□□ -1.65
DDI1P40087 SPO7YAL009W 780 nt4.75□□□□□ -1.65
DDI1P40087 SCP1YOR367W 603 nt4.75□□□□□ -1.65
DDI1P40087 RPL21BYPL079W 483 nt4.75□□□□□ -1.65
DDI1P40087 snR17bsnR17b 332 nt4.75□□□□□ -1.65
DDI1P40087 DCC1YCL016C 1143 nt4.75□□□□□ -1.65
DDI1P40087 PEX29YDR479C 1665 nt4.75□□□□□ -1.65
DDI1P40087 PRO2YOR323C 1371 nt4.75□□□□□ -1.65
DDI1P40087 YJL206CYJL206C 2277 nt4.75□□□□□ -1.65
DDI1P40087 LYS21YDL131W 1323 nt4.74□□□□□ -1.65
DDI1P40087 MDR1YGR100W 2853 nt4.74□□□□□ -1.65
DDI1P40087 IRC7YFR055W 1023 nt4.74□□□□□ -1.65
DDI1P40087 SEC13YLR208W 894 nt4.74□□□□□ -1.65
DDI1P40087 ECM19YLR390W 339 nt4.74□□□□□ -1.65
DDI1P40087 SHP1YBL058W 1272 nt4.74□□□□□ -1.65
DDI1P40087 MRI1YPR118W 1236 nt4.74□□□□□ -1.65
DDI1P40087 DBF2YGR092W 1719 nt4.74□□□□□ -1.65
DDI1P40087 PRR1YKL116C 1557 nt4.74□□□□□ -1.65
DDI1P40087 SCS2YER120W 735 nt4.73□□□□□ -1.65
DDI1P40087 SKI6YGR195W 741 nt4.73□□□□□ -1.65
DDI1P40087 SCW10YMR305C 1170 nt4.73□□□□□ -1.65
DDI1P40087 ETT1YOR051C 1239 nt4.73□□□□□ -1.65
DDI1P40087 YCL012CYCL012C 405 nt4.73□□□□□ -1.65
DDI1P40087 AXL2YIL140W 2472 nt4.73□□□□□ -1.65
DDI1P40087 BRL1YHR036W 1416 nt4.72□□□□□ -1.65
DDI1P40087 ATH1YPR026W 3636 nt4.72□□□□□ -1.65
DDI1P40087 PTR2YKR093W 1806 nt4.72□□□□□ -1.65
DDI1P40087 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt4.72□□□□□ -1.65
DDI1P40087 SLC1YDL052C 912 nt4.72□□□□□ -1.65
DDI1P40087 RSM10YDR041W 612 nt4.72□□□□□ -1.65
DDI1P40087 NAG1YGR031C-A 492 nt4.72□□□□□ -1.65
DDI1P40087 SEN34YAR008W 828 nt4.72□□□□□ -1.65
DDI1P40087 YLR126CYLR126C 756 nt4.72□□□□□ -1.65
DDI1P40087 ETR1YBR026C 1143 nt4.72□□□□□ -1.65
DDI1P40087 MET31YPL038W 534 nt4.72□□□□□ -1.65
DDI1P40087 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt4.72□□□□□ -1.65
DDI1P40087 TUB3YML124C 1338 nt4.72□□□□□ -1.65
DDI1P40087 CRT10YOL063C 2874 nt4.71□□□□□ -1.65
DDI1P40087 HOT1YMR172W 2160 nt4.71□□□□□ -1.65
DDI1P40087 TOS4YLR183C 1470 nt4.71□□□□□ -1.66
DDI1P40087 CAD1YDR423C 1230 nt4.71□□□□□ -1.66
DDI1P40087 TEF4YKL081W 1239 nt4.71□□□□□ -1.66
DDI1P40087 BLM10YFL007W 6432 nt4.71□□□□□ -1.66
DDI1P40087 FAA3YIL009W 2085 nt4.71□□□□□ -1.66
DDI1P40087 PMA1YGL008C 2757 nt4.7□□□□□ -1.66
DDI1P40087 KCH1YJR054W 1494 nt4.7□□□□□ -1.66
DDI1P40087 PGM2YMR105C 1710 nt4.7□□□□□ -1.66
DDI1P40087 LHP1YDL051W 828 nt4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 34.1 ms