Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF4A3P38919 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF4A3P38919 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms