Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPARGP37231 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPARGP37231 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPARGP37231 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PPARGP37231 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPARGP37231 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPARGP37231 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PPARGP37231 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPARGP37231 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPARGP37231 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPARGP37231 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPARGP37231 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPARGP37231 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPARGP37231 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPARGP37231 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPARGP37231 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPARGP37231 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPARGP37231 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPARGP37231 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPARGP37231 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPARGP37231 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPARGP37231 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPARGP37231 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPARGP37231 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPARGP37231 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPARGP37231 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPARGP37231 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPARGP37231 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPARGP37231 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPARGP37231 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPARGP37231 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPARGP37231 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPARGP37231 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPARGP37231 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPARGP37231 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPARGP37231 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPARGP37231 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPARGP37231 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPARGP37231 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPARGP37231 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPARGP37231 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPARGP37231 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPARGP37231 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPARGP37231 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPARGP37231 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPARGP37231 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPARGP37231 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPARGP37231 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPARGP37231 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPARGP37231 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPARGP37231 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPARGP37231 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPARGP37231 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPARGP37231 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPARGP37231 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PPARGP37231 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPARGP37231 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPARGP37231 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPARGP37231 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPARGP37231 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPARGP37231 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPARGP37231 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PPARGP37231 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPARGP37231 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPARGP37231 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PPARGP37231 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PPARGP37231 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPARGP37231 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PPARGP37231 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PPARGP37231 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPARGP37231 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPARGP37231 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPARGP37231 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PPARGP37231 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPARGP37231 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPARGP37231 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPARGP37231 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPARGP37231 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPARGP37231 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPARGP37231 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPARGP37231 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPARGP37231 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPARGP37231 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPARGP37231 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PPARGP37231 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPARGP37231 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPARGP37231 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPARGP37231 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPARGP37231 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPARGP37231 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPARGP37231 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPARGP37231 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPARGP37231 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPARGP37231 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPARGP37231 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPARGP37231 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPARGP37231 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPARGP37231 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPARGP37231 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPARGP37231 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111 ms