Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPN7P35236 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN7P35236 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.2 ms